Mit Hilfe der Endodontie versucht man Entzündungen in der Markhöhle (= Endodont) des Zahnes zu heilen. Diese Entzündungen entstehen durch Unfälle oder fortgeschrittene bakterielle Erkrankungen, welche den Zahnnerv im Inneren der Zahnhartsubstanz erreicht haben.
Die Heilung einer solchen Erkrankung ist durch die sog. Wurzelbehandlung möglich. Dabei wird das infizierte Gewebe mit kleinsten Feilen aus dem Zahninneren entfernt und mit Hilfe von Spülflüssigkeit nach außen transportiert. Es ist wichtig, dass der dabei entstehende Hohlraum desinfiziert und anschließend bakteriendicht gefüllt wird.
Durch moderne Technik und neue wissenschaftliche Erkenntnisse ist dieser Vorgang heutzutage weniger kritisch zu bewerten als noch vor einigen Jahren. Durch Wurzelbehandlungen können Zähne gerettet werden, die dann noch über Jahre und Jahrzehnte hinweg weiterhin in Funktion bleiben können und nicht ersetzt werden müssen.